Hallo LilPumpsHose,
davon dass die Pfannkuchen nicht ganz durch sind, bekommt man im Normalfall nicht so heftige Probleme wie Bauchschmerzen und Durchfall.
Die einzige Erklärung wäre, dass eine der Zutaten im Teig nicht gut war. Am ehesten kommen da die Eier oder die Milch in Frage.
Falls es anhält, gehe am besten mal zu einem Arzt.
Gute Besserung!